Trong bối cảnh số hóa đang diễn ra mạnh mẽ trên toàn cầu, các công ty công nghệ cao đóng vai trò quan trọng trong việc thúc đẩy sự đổi mới và sáng tạo, nâng cao năng lực cạnh tranh giữa Việt Nam và các quốc gia khác. Nhằm khuyến khích sự phát triển của lĩnh vực, chính phủ đã ban hành nhiều chính sách ưu đãi thuế đối với doanh nghiệp công nghệ cao.
Trong nội dung dưới đây, Kế toán Liên Thành giúp bạn tìm hiểu đầy đủ về các chương trình ưu đãi dành riêng cho lĩnh vực trong năm nay.
Doanh nghiệp công nghệ nào được miễn, giảm thuế?
- Công ty IT: thường cung cấp những dịch vụ về công nghệ thông tin (CNTT) như tư vấn giải pháp CNTT, phát triển hệ thống và hạ tầng mạng, bảo trì hệ thống mạng.
- Startup công nghệ: chuyên cung cấp những sản phẩm mới trên nền tảng số hay những giải pháp công nghệ khác biệt.
- Công ty phần mềm: thực hiện thiết kế, phát triển và triển khai những phần mềm hữu dụng như ứng dụng di động, hệ thống điều hành quản lý, phần mềm quản lý.
- Công ty nghiên cứu và phát triển R&D: doanh nghiệp chuyên nghiên cứu công nghệ mới, phát triển cải tiến sản phẩm công nghệ cao, thử nghiệm các mô hình cải tiến và sáng tạo.
- Công ty sản xuất sản phẩm công nghệ cao: các sản phẩm có thể là robot, thiết bị điện tử, linh kiện, công nghệ sinh học.
- Doanh nghiệp chuyển đổi số: tư vấn, xây dựng và phát triển những giải pháp để số hóa dữ liệu, quy trình vận hành cho công ty.

Quy định về miễn giảm thuế TNDN đối với doanh nghiệp công nghệ
Nhà nước Việt Nam ban hành nhiều chính sách ưu đãi về thuế TNDN để thúc đẩy ngành công nghệ cao (CNC). Theo Luật Thuế TNDN và Nghị định 218/2013/NĐ-CP, doanh nghiệp có thể được hưởng các ưu đãi là:
- Hưởng thuế suất ưu đãi 10%, thấp hơn so với mức thuế thông thường là 20%.
- Miễn thuế TNDN trong 4 năm đầu và giảm 50% số thuế phải nộp trong 9 năm tiếp.
Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp cho công ty công nghệ
Ưu đãi thuế suất 10% dành cho ngành công nghệ cao
Thuế TNDN của các doanh nghiệp thông thường là 20% nhưng với doanh nghiệp thực hiện dự án đầu tư mới trong lĩnh vực CNTT thì được hưởng thuế suất ưu đãi bằng ½, tức 10%. Đối tượng được hưởng ưu đãi bao gồm:
- Những tổ chức, doanh nghiệp thực hiện dự án đầu tư mới trong lĩnh vực CNTT tại khu công nghiệp (KCN) tập trung.
- Thu nhập của doanh nghiệp từ dự án đầu tư mới tại khu công nghệ cao, bao gồm cả khu CNTT tập trung.
- Thu nhập của doanh nghiệp từ dự án đầu tư mới thuộc lĩnh vực như nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ, ứng dụng công nghệ cao, ươm tạo công nghệ cao.
- Doanh nghiệp CNC, doanh nghiệp nông nghiệp ứng dụng CNC có phần thu nhập từ hoạt động CNC.
Miễn thuế 4 năm, giảm 50% trong 9 năm cho doanh nghiệp phần mềm
Theo Điều 22 Nghị định 154/2013/NĐ-CP, Điều 20 Thông tư 78/2014/TT-BTC và Điều 12 Thông tư 96/2015/TT-BTC, những doanh nghiệp nêu trên được hưởng ưu đãi miễn thuế 4 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 9 năm, kể từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế.

Điều kiện để công ty công nghệ được miễn giảm thuế TNDN
- Những ưu đãi về thuế TNDN chỉ áp dụng cho những doanh nghiệp thực hiện chế độ kế toán hóa đơn, chứng từ và nộp thuế TNDN theo kê khai.
- Trong thời gian được hưởng ưu đãi thuế TNDN, nếu doanh nghiệp triển khai nhiều hoạt động sản xuất, kinh doanh thì phải tính riêng khoản thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh được hưởng ưu đãi thuế TNDN và khoản thu nhập từ hoạt động không được hưởng để kê khai nộp riêng.
Doanh nghiệp sản xuất phần mềm được ưu đãi thuế gì?
Ưu đãi khi xuất bản phần mềm
Xuất bản phần mềm là quá trình đưa phần mềm công khai đến thị trường dưới hình thức có giấy phép với mục đích thương mại hoặc quảng bá rộng rãi. Theo Luật Thuế TNDN và Điều 19 Nghị định 218/2013/NĐ-CP, công ty hoạt động trong lĩnh vực xuất bản phần mềm được hưởng thuế suất ưu đãi là 10% trong vòng 15 năm, miễn thuế TNDN trong 4 năm và giảm 50% thuế suất trong vòng 9 năm tiếp theo.
Ưu đãi với hoạt động gia công phần mềm
Gia công phần mềm là hình thức nhận đặt hàng một phần hay toàn bộ dự án thuộc về phần mềm. Những doanh nghiệp gia công chỉ thực hiện vai trò là bên thực hiện chứ không sở hữu phần mềm đó. Công ty này không được hưởng lợi nhuận liên quan đến sản phẩm và mọi chi phí hoàn thiện dự án đều do bên thuê gia công chi trả. Ưu đãi đối với doanh nghiệp gia công phần mềm gồm:
- Thuế suất ưu đãi 10% trong thời hạn là 15 năm
- Miễn thuế TNDN 4 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 9 năm tiếp theo
Ưu đãi cho công ty thiết kế website chuyên biệt
Doanh nghiệp thiết kế website chuyên biệt được hưởng ưu đãi về thuế nếu hoạt động thiết kế thỏa mãn điều kiện là xây dựng phần mềm theo Thông tư 09/2013/TT-BTTTT. Cụ thể, website phải được thiết kế như một phần mềm ứng dụng độc lập, có chức năng rõ ràng, có mã nguồn thì được hưởng mức thuế 10% trong 15 năm, miễn thuế 4 năm đầu và giảm 50% mức thuế suất trong 9 năm tiếp theo.

Ưu đãi thuế cho doanh nghiệp công nghệ cao
Ưu đãi cho doanh nghiệp có sản phẩm công nghệ cao
Doanh nghiệp có sản phẩm công nghệ cao là công ty sản xuất sản phẩm thuộc danh mục sản phẩm CNC được quy định tại Quyết định 66/2014/QĐ-TTg. Những doanh nghiệp này sẽ được hưởng ưu đãi là:
- Miễn thuế 4 năm, giảm 50% thuế suất trong 9 năm tiếp theo, hưởng thuế suất ưu đãi 10% trong vòng 15 năm.
- Theo Điều 18 Luật Công nghệ cao 2008, doanh nghiệp còn đương hưởng ưu đãi cao nhất về thuế GTGT, thuế xuất khẩu và thuế nhập khẩu những linh kiện, thiết bị không sản xuất trong nước.
Ưu đãi thuế thu nhập cá nhân dành cho chuyên gia công nghệ
Đối tượng được giảm 50% thuế TNCN trong ngành công nghệ bao gồm:
- Người có trình độ và kỹ năng đáp ứng yêu cầu của hoạt động nghiên cứu, phát triển, ứng dụng CNC trong lĩnh vực CNTT.
- Người vận hành thiết bị, dây chuyền sản xuất sản phẩm CNC trong lĩnh vực CNTT.
- Người quản lý an toàn hệ thống thông tin.
Điều kiện để áp dụng chính sách giảm thuế TNCN gồm:
- Có hợp đồng lao động với doanh nghiệp trong khu CNC
- Trình độ chuyên môn phù hợp với Luật Công nghệ cao 2008 về lĩnh vực CNC.
- Có hồ sơ xác nhận từ Ban Quản lý khu CNC.
Khi chuyên gia công nghệ tự quyết toán hoặc sử dụng dịch vụ quyết toán thuế cá nhân sẽ được hưởng ưu đãi thuế là miễn thuế TNCN trong 2 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 4 năm tiếp theo đối với thu nhập từ tiền công, tiền lương do doanh nghiệp trả.

Miễn thuế nhập khẩu đối với thiết bị phục vụ R&D
Theo Điều 16 Luật 107/2016/QH13 và Điều 13 Nghị định 134/2016/NĐ-CP, doanh nghiệp có dự án hay bộ phận nghiên cứu và phát triển R&D công nghệ cao được miễn thuế nhập khẩu đối với máy móc, linh kiện, thiết bị không sản xuất được trong nước. Những thiết bị này phải phục vụ trực tiếp cho hoạt động R&D và có hồ sơ để chứng minh công năng sử dụng rõ ràng.
Doanh nghiệp công nghệ cao được hưởng ưu đãi thuế bao nhiêu năm?
Điều 20 Nghị định 218/2013/NĐ-CP, doanh nghiệp công nghệ cao được hưởng ưu đãi thuế trong thời hạn như sau:
- Thuế suất ưu đãi 10% trong 15 năm
- Miễn thuế 4 năm đầu đối với khoản thu nhập chịu thuế
- Giảm 50% thuế suất trong 9 năm tiếp theo
- Trong một số trường hợp đặc biệt như dự án quy mô lớn, dự án công nghệ đặc biệt quan trọng, thời gian áp dụng thuế suất 10% có thể kéo dài lên tối đa 30 năm.
Ưu đãi thuế dành cho doanh nghiệp công nghệ thông tin (CNTT)
Các ngành nghề CNTT nào được ưu đãi thuế?
Các ngành nghề CNTT được ưu đãi thuế gồm sản xuất phần mềm, gia công phần mềm, nghiên cứu và phát triển sản phẩm CNTT, dịch vụ vụ bảo trì hệ thống. Sản phẩm của những ngành nghề phải thuộc danh mục sản phẩm phần mềm và phần cứng, điện tử được quy định tại Thông tư 09/2013/TT-BTTTT.
Dịch vụ phần mềm có được ưu đãi không?
Dịch vụ phần mềm sẽ được áp dụng chương trình ưu đãi thuế nếu thuộc danh mục sản phẩm phần mềm trong Thông tư 09/2013/TT-BTTTT. Những dịch vụ được hưởng ưu đãi phổ biến bao gồm tư vấn phần mềm, bảo trì phần mềm, xây dựng phần mềm, đào tạo và sử dụng phần mềm.
Điều kiện chứng nhận doanh nghiệp CNTT được ưu đãi
Điều kiện để doanh nghiệp CNTT được hưởng ưu đãi miễn giảm thuế gồm:
- Hoạt động trong lĩnh vực phần mềm, dịch vụ CNTT, phần cứng
- Sản phẩm hoặc dịch vụ của doanh nghiệp thuộc danh mục sản phẩm phần mềm, phần cứng hoặc điện tử được quy định tại Thông tư 09/2013/TT-BTTTT.
- Có giấy chứng nhận doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực CNTT thỏa mãn điều kiện ưu đãi
Những ngành công nghệ không được hưởng ưu đãi thuế
- Ngành công nghệ viễn thông có dây, không dây, viễn thông vệ tinh
- Hoạt động dịch vụ thông tin như xử lý dữ liệu, cho thuê cổng thông tin
- Ngành thương mại điện tử giao dịch thuần túy
- Ngành thiết kế đồ họa gắn với phần mềm
- Ngành quảng cáo trực tuyến áp dụng công nghệ hiện có
Cần chuẩn bị gì để được áp dụng ưu đãi thuế công nghệ?
- Giấy chứng nhận sản xuất phần mềm được cấp bởi Sở Thông tin và Truyền thông hoặc giấy chứng nhận doanh nghiệp công nghệ cao được cấp bởi Bộ Khoa học và Công nghệ hoặc Ban Quản lý khu công nghệ cao
- Mã ngành kinh doanh đúng với hệ thống ngành kinh tế Việt Nam như 6201 cho lập trình máy vi tính, 6202 (tư vấn máy tính và quản trị hệ thống máy tính), 7211-72110: nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ cho lĩnh vực khoa học tự nhiên, 7212-72120: nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ cho lĩnh vực khoa học kỹ thuật và công nghệ…
Theo Thông tư 78/2014/TT-BTC và Thông tư 16/2014/TT-BTTTT, hồ sơ và thủ tục cần nộp lên cơ quan thuế gồm giấy tờ:
- Văn bản đề nghị được áp mức thuế suất ưu đãi
- Giấy phép đăng ký kinh doanh đúng với mã ngành
- Giấy chứng nhận doanh nghiệp sản xuất phần mềm hoặc ứng dụng CNC
- Hợp đồng sản phẩm, dịch vụ về phần mềm hoặc CNC
- Văn bản mô tả quy trình sản xuất phần mềm (nếu có)
- Báo cáo tài chính doanh nghiệp
Những câu hỏi thường gặp về ưu đãi thuế đối với doanh nghiệp công nghệ
Sai sót thường gặp nào khiến doanh nghiệp công nghệ bị từ chối ưu đãi?
- Doanh nghiệp không đăng ký đúng mã ngành kinh doanh
- Không tách riêng phần doanh thu được hưởng từ sản phẩm/ dịch vụ ưu đãi với phần doanh thu có được từ sản phẩm/ dịch vụ không được ưu đãi trong BCTC.
- Không có giấy chứng nhận sản xuất phần mềm hoặc sản phẩm nằm trong danh mục ưu đãi.
Thời điểm nào là tốt nhất để doanh nghiệp công nghệ cao đăng ký hưởng ưu đãi?
Thời điểm tốt nhất để doanh nghiệp công nghệ cao đăng ký hưởng ưu đãi là ngay khi bắt đầu hoạt động sản xuất kinh doanh hoặc trước thời điểm thực hiện quyết toán thuế đầu tiên cho năm tài chính. Việc này giúp doanh nghiệp nhận được phần thuế ưu đãi kịp thời, tránh phải nộp nhiều hơn so với mức thu thực tế.



